Может ли такое быть, что при нехватке давления воды страдает только один стояк?

Если он тупиковый от ввода может быть проблема в часы пик. В остальное время давление будет везде одинаково. Ну это если ничего не накрутили со схемой водоснабжения.

Закон Паскаля - давление, производимое на покоящуюся жидкость или газ, передается в любую точку жидкости или газа одинаково по всем направлениям.

Йожык, я так понимаю у вас новый дом? Горячую воду в многоквартирных домах через теплообменики начали делать относительно недавно. Соответственно насос на воде холодной или горячей должен быть (если по уму) подключен через частотный регулятор оборотов и рывков давления быть не должно. Но если давление холодной воды идущей на теплообменник  падает критически, то срабатывает защита по сухому ходу и насос может "затыкаться" и цикл повторяется снова. Но дело в том, что такая проблема будет у всех или большинства квартир верхних этажей соответствующей зоны водоснабжения.

Теперь другой вопрос. Циркуляция в системе ГВС может быть выполнена как отдельным насосом, так и пуском части воды рециркуляцией обратно на насос. Равнозначно два варианта циркуляции не могут повлиять на общий объем воды в системе, так как она никуда не девается.

Вам нужно уточнить схему горячего водоснабжения. Так же не мешало бы узнать когда последний раз промывался теплообменник (если ГВС приготовляется в нем). На работе мойка теплообменников у нас раз в два-три месяца.